公元2030年，在一群天才科学家的带领下，生物工程学取得了极大突破，但所有新技术都会很快转化为军用，导致新一代军备竞争的开始。“尖兵”作为本时代生物工程学的最高成就、最尖端的武器，被广泛运用其中。虽然尖兵有着常人所不能及的战斗力，但由于纳米机器会透支生命，大部分尖兵在一定年限后，都会提前退役。 女主角琉璃在长久执行任务之后，她的生命也被严重透支。最后只剩下380天生命的琉璃，接到了一个新的任务——去一个平民设施中解救人质。 对于只会杀戮和战斗的她来说，这无疑是艰难的，但服从命令的她，依然执行了这个任务。

公元2030年，在一群天才科学家的带领下，生物工程学取得了极大突破，但所有新技术都会很快转化为军用，导致新一代军备竞争的开始。“尖兵”作为本时代生物工程学的最高成就、最尖端的武器，被广泛运用其中。虽然尖兵有着常人所不能及的战斗力，但由于纳米机器会透支生命，大部分尖兵在一定年限后，都会提前退役。女主角琉璃在长久执行任务之后，她的生命也被严重透支。最后只剩下380天生命的琉璃，接到了一个新的任务——去一个平民设施中解救人质。对于只会杀戮和战斗的她来说，这无疑是艰难的，但服从命令的她，依然执行了这个任务。在这次

公元2030年，经历了4次世界大战的世界面临更严峻的挑战。随着人类义体化等科技的不断发展，犯罪行为也日渐离奇复杂。为了解决这类案件，日本内务省的直属部队——公安9课，这个对外不存在的特种部队，在队长草薙素子的带领下向恶势力发起制裁。而面对公安9课的，是高度发达的科技下创造的案件、权力政治斗争的阴谋、与以笑脸男为代表的Stand Alone Complex犯罪。